Este deporte, era en aquel entonces el más popular de Honduras, pero con el paso del tiempo, camisetas fútbol baratas el fútbol fue tomando un gran auge en el país. A merced de este acuerdo el equipo consigue una gran cantera de aproximadamente treinta equipos y la Ciudad Deportiva de Castañares perteneciente al Promesas. El presidente le encomienda que haga una plantilla competitiva pero con poco presupuesto, ya que la política austera del presidente desde que tomó el mando del club, hace que para la confección de la plantilla destine un porcentaje muy pequeño del presupuesto anual total, siendo este uno de los más altos de toda la Segunda División B, con el fin a largo plazo de ir reduciendo la pequeña deuda que arrastra el club desde hace años. En el verano de 2016, el club decide no inscribir al equipo filial en la Primera División Regional Aficionados, por el poco provecho que saca la primera plantilla del equipo filial y viendo los gastos que acarrea, lo hace desaparecer. Entre los preparadores más destacados de la historia del club, es preciso mencionar al argentino Roque Olsen, el cual dirigió al equipo a su primer ascenso a la Primera División. En la temporada 1971/72, el Burgos Club de Fútbol se estrenó en Primera División.
Para la temporada 2021-22 le tocaba empezar de nuevo desde Segunda RFEF, la categoría más baja en la que había estado desde el año 1985 cuando estuvo en Tercera División. Tercera de la anterior temporada, los cuatro semifinalistas de la Copa RFEF y 10 equipos de la máxima categoría territorial. Al finalizar la temporada, el presidente José Luis Preciado deja la presidencia y le sustituye Antonio Martínez Laredo. ↑ «Franco Caselli asume la Presidencia del Burgos CF». ↑ «José Luis García gana la elecciones a la Presidencia del Burgos CF | Las noticias de Burgos según suceden | BurgosConecta.es». El Burgos CF finalizó el año 2020 en la decimocuarta posición del Grupo 2, con seis partidos ganados, cinco empatados y nueve perdidos. La temporada 2013/14 en Primera División Regional Aficionados, el equipo tiene la base de jugadores jóvenes que consiguieron el ascenso el año anterior. Jugadores como Alberto Terry, Guillermo Barbadillo, Valeriano López, Félix Castillo y Óscar Gómez Sánchez contribuyeron a la competitividad del seleccionado a lo largo de esos años. Ella tiene 15 años y vive en una isla, hasta que decide mudarse a Tokio y entrar a la escuela Aoba solo para chicos (por lo que tiene que disfrazarse como uno) para vencer en futbol a su mayor rival Tsukasa Hino.
Hasta la inauguración del estadio en 1964 y desde principios de la década de los años veinte, el club disputaba sus encuentros en el campo de Laserna, junto a la antigua estación de ferrocarril. El broche de oro a la temporada llegó con el ascenso a Segunda División B tras eliminar a la UD Lanzarote en el play off de ascenso, en un Estadio Municipal de El Plantío que vibró con su equipo como hacía muchos años que no lo hacía. La temporada 2011/12 en Segunda División B fue nefasta para el club. Le sustituye al final de la temporada Raúl González que no evita el desastre y el club acaba descendiendo a la Tercera División en la última jornada tras un empate 1-1 en la Nueva Balastera ante el CF Palencia. Al finalizar la temporada se anuncia el adiós de Ramón Calderé, el entrenador que consiguió el ascenso el año anterior y la permanencia en la división de bronce del fútbol español.
Para afrontar el debut en la categoría, llegó al banquillo burgalés el entrenador Mariano Moreno, y se lograron las cesiones de los jugadores Capón, Benegas y Jaquet del Atlético de Madrid y de Aitor Aguirre del Athletic Club. Fabri toma el mando en el banquillo y consigue clasificar al equipo para el play off de ascenso. En el play off de ascenso, es eliminado por el Sporting Mahonés en la segunda eliminatoria, después de haber apeado al conjunto vasco del Elgoibar en la primera. Se conforma una plantilla para estar en los puestos altos de la clasificación, pero el comienzo no puede ser más nefasto y el equipo consigue 1 punto en 6 partidos disputados, además de ser eliminado en la primera ronda de la Copa del Rey a manos del Caudal Deportivo. Subcampeón de la Copa del Rey 2001, final jugada en el Estadio de la Cartuja (Sevilla), entre el Celta de Vigo y el Zaragoza. Pérez Tokilla (Oviedo y Deportivo), Pedro María Herrera (Salamanca, Celta y Zaragoza), Toni Gorriaran (Oviedo y Alavés) y Savin Bilbao (Deportivo de la Coruña) forman también parte de la inestimable aportación del Erandio a la élite del fútbol.