A partir de la edición de 1999, la Asociación Uruguaya de Fútbol incorporó a equipos del interior del país (por fuera de su capital, Montevideo) para que participaran directamente del Campeonato Uruguayo, camiseta del inter de miami buscando la integración nacional (curiosamente para el campeonato de ese mismo año Frontera de Rivera había camiseta de españa 2024 logrado el ascenso). Comenzó a disputarse en el año 1900 y lleva 120 ediciones. Desde el inicio del Campeonato Uruguayo en 1900, en la mayoría de las ediciones se realizó al menos una copa oficial, organizada por la Asociación Uruguaya de Fútbol, aunque en las últimas décadas esto casi no ocurrió. El primer equipo uruguayo dedicado principalmente a la práctica del fútbol fue el Albion Football Club, fundado el 1 de junio de 1891. El 30 de marzo de 1900 es fundada la Uruguay Association Foot-ball League por cuatro equipos (CURCC, Albion, Uruguay Athletic y Deutscher), con el fin de organizar el fútbol en el país y sus campeonatos. Si un mismo equipo gana el Apertura y el Clausura, y no la anual, se jugará una final entre el campeón de la anual y el campeón de ambos torneos.
Para definir al campeón de la temporada, luego de disputados los torneos, se realizan las finales por el Campeonato Uruguayo: en las cuales participan, en carácter de semifinal, los campeones del Torneo Apertura y Torneo Clausura, y el ganador de este partido define la final contra el ganador de la Tabla Anual (suma de puntos de todos los torneos de la temporada: Apertura, Intermedio y Clausura). Desde la edición 2017 los cupos se definen así: El campeón uruguayo clasificará a la fase de grupos de la Libertadores, el vicecampeón uruguayo (sea el perdedor en las finales o el segundo mejor clasificado de la Anual) también clasificará a la fase de grupos de la Libertadores. Hasta entonces, el campeonato uruguayo se disputaba generalmente con el clásico sistema de liga a dos rondas (con variaciones en las distintas décadas, por momentos se disputaron tres rondas, en otros se incorporó una liguilla final entre los mejores, etc.). A lo largo de su historia un total de sesenta clubes han participado de la liga (treinta y nueve en la era profesional), siendo el Club Nacional de Football, el equipo con más presencias con 119 (solo no jugó la edición inaugural).
El partido con más goles anotados, catorce, se produjo el 5 de mayo de 1933 cuando el Athletic Club venció por 9-5 al Real Racing Club de Santander. 1. El que tuviese una mayor diferencia entre goles a favor y en contra en los enfrentamientos entre ambos. En general, nunca se contó con un sistema de ligas que incluya la disputa de una copa doméstica que posibilite enfrentamientos entre equipos de las tres divisionales existentes, aunque si tuvo en gran parte de su historia la realización de copas en paralelo, pero solo para equipos de la Primera División. En 1980, el Torneo Metropolitano pasó a llamarse Campeonato de Primera División, aunque extraoficialmente se siguió nombrando como tal. Es considerada como la 23.ª del mundo en el siglo XXI según el ranking oficial de la Federación Internacional de Historia y Estadística de Fútbol (IFFHS). En 1923 la Federación Uruguaya de Football organizó el Campeonato Uruguayo de Suficiencia, en el cual participaron 32 clubes. El más significativo fue el paso de un formato de todos contra todos en dos ruedas, a una división de la temporada en dos torneos cortos (Torneo Apertura y Torneo Clausura), los cuales, junto con la tabla acumulada (Tabla anual), dan el acceso hacia la definición del Campeonato Uruguayo desde la temporada 1994. A partir del 2017 se incorporó un nuevo torneo corto al Campeonato Uruguayo, que se disputa entre el Apertura y el Clausura, llamado por esta razón Torneo Intermedio.
Durante 1908, tanto el CURCC como Nacional terminaron sin presentarse a los últimos partidos del torneo por desacuerdos con algunos fallos arbitrales, y terminaron generando su propio torneo de forma paralela, llamado Copa Cat, en homenaje al gerente de la Sociedad Comercial de tranvías, Juan Cat, habitual colaborador del fútbol. En 2005 se cambia el orden de los torneos, pasando a disputarse el Apertura en la segunda del año y el Clausura en la primera mitad del año siguiente, de forma de acompasar la temporada al calendario europeo. La institución reconocida por la FIFA y la Conmebol siguió siendo la Asociación Uruguaya de Fútbol, que ese mismo año lograría obtener por cuarta vez el Campeonato Sudamericano de selecciones disputado en Montevideo, clasificando a los Juegos Olímpicos de París del año siguiente, donde la selección conquistaría la medalla de oro con un plantel conformado únicamente por jugadores pertenecientes a la AUF. En septiembre de 1922, pocos días antes de viajar a Brasil para disputar la Copa América, Peñarol exigió a la AUF que la selección uruguaya no enfrentara a la argentina, que era defendida por jugadores que participaban en la AFA, afiliada a la FIFA.